El Castell de Sant Gregori té orígens medievals i, durant segles, va tenir un paper destacat a la comarca de Girona per la seva ubicació i funció estratègica. Va formar part de les propietats de la família Margarit, un llinatge noble amb influència política, religiosa i marítima. Un dels seus membres més coneguts, Bernat de Margarit, va participar en els viatges de Cristòfor Colom. Al llarg del temps, la família va acumular terres i poder, ampliant la seva presència per Catalunya i establint vincles amb la cort i altres institucions del moment. El castell, com a part d’aquest entramat, va passar per diferents etapes, usos i propietaris, adaptant-se als canvis socials i econòmics de cada època.